Durante la época colonial, el territorio que hoy ocupa Nueva York estaba poblado por diversas naciones indígenas. A continuación se presentan las principales confederaciones y tribus que habitaban la región.
Confederación iroquesa
- Mohawk
- Seneca
- Onondaga
- Oneida
- Cayuga
Tribus algonquinas
- Wappinger
- Delaware
- Munsee
- Mahican
- Pequot
Otras tribus nativas
- Shinnecock
- Montauk
- Unkechaug
- Metoac
- Rumachenock