A través de Simoun (el protagonista principal), la novela mostró la opción de utilizar la violencia y medios radicales, algo que temía el movimiento reformista de la época. Sin embargo, el camino violento de Simoun fue retratado con repercusiones negativas, sugiriendo que la violencia no era el mejor camino a seguir.
En general, "El Filibusterismo" sirvió para fortalecer aún más el movimiento reformista al brindar una perspectiva alternativa y desafiar el enfoque no violento que el movimiento había adoptado anteriormente.