1. La Proclamación solo se aplicó a los esclavos en territorio controlado por los confederados que todavía estaban en rebelión en ese momento. Esto significaba que los esclavos en los estados fronterizos que eran leales a la Unión, así como los esclavos en territorio confederado que ya habían sido capturados, no fueron liberados por la declaración.
2. La Proclamación de Emancipación dependía del éxito de las fuerzas confederadas. Si la Unión no hubiera salido ganadora, la declaración habría sido revocada y la esclavitud habría permanecido intacta en los estados confederados.
3. Muchos sureños no reconocieron la autoridad del gobierno federal y vieron la Proclamación de Emancipación como un decreto injusto e ilegal. Esta resistencia restringió la implementación de la proclamación en muchas áreas.
4. La declaración no abordó las complejidades de la vida posterior a la emancipación de los esclavos liberados, incluidos sus derechos, oportunidades económicas y estatus social. Su principal objetivo era socavar al ejército confederado y apoyar los esfuerzos militares de la Unión, pero no proporcionó un plan integral para la integración y el apoyo de la población recién liberada.
5. A pesar de la Proclamación de Emancipación, la esclavitud persistió en algunas regiones remotas y aisladas donde la autoridad de la Unión no estaba plenamente establecida ni aplicada. La abolición total de la esclavitud en los Estados Unidos no se logró hasta la aprobación de la Decimotercera Enmienda a la Constitución en 1865.