Acusaciones del Departamento Príncipe
El Departamento Príncipe estaba muy descontento con la conducta del estado de Bharatpur y presentó una lista de cargos contra el Maharajá Brijendra Singh. Las acusaciones incluían:
- No celebrar el Día de la Independencia el 15 de agosto de 1947 y solicitar abiertamente la partición de la India.
- Expulsar a 100 000 musulmanes del territorio, alegando que no quedaba ninguno.
- No garantizar la seguridad de la línea ferroviaria Bandikui‑Agra que atravesaba el estado.
- Falta de disciplina en su ejército.
- Fomentar el jatismo en la región.
- Operar una fábrica ilegal de armas y municiones, distribuyéndolas a Jats y a miembros del Rashtriya Swayamsevak Sangh (RSS).
- Apoyar las actividades del RSS.
- Según una carta de Pt. Nehru del 28 de enero de 1948, se estaba impartiendo entrenamiento militar a voluntarios nacionales en Bharatpur.
Presión del Gobierno de la India
El 10 de febrero de 1948 el Gobierno de la India convocó al Maharajá a Nueva Delhi, le expuso los cargos y le ordenó ceder la administración del estado al gobierno central. Bajo una fuerte presión y tras la detención domiciliaria del Maharajá de Alwar, el Maharajá de Bharatpur aceptó a regañadientes.
Nombramientos y la intervención de Sardar Patel
El 14 de febrero de 1948 S. N. Sapru fue designado administrador de Bharatpur y el coronel Dhillon, jefe del Estado Mayor del ejército. El hermano del Maharajá, Girirajsharan Singh, fue deportado a Inglaterra tras la solicitud de Nehru a Sardar Patel.
Lord Mountbatten, primer Gobernador General de la India independiente, quiso deportar al Maharajá de Bharatpur por supuestos crímenes comunales y mala administración, y enviarlo al sur bajo arresto domiciliario. Sin embargo, Sardar Patel intervino y protegió su destino.
Integración en la Unión
Los monarcas de Dholpur y Karauli, vecinos de Alwar y Bharatpur, fueron citados a Delhi el 27 de febrero de 1948. Todos aceptaron la propuesta de integrar sus reinos al resto de la India y firmaron el acuerdo el 28 de febrero.
Siguiendo el consejo de M. Munshi, la unión se llamó Matsya Sangh. Dado que se investigaban los casos de Alwar y Bharatpur, el Maharajá de Dholpur se nombró Rajpramukh y el de Karauli, Uprajpramukh. La unión se inauguró el 18 de marzo de 1948.
Investigación y absolución
Lord Mountbatten formó un comité con los gobernantes de Baroda, Gwalior, Nawanagar y Bikaner para investigar a los maharajás de Alwar y Bharatpur, pero éstos se negaron a colaborar. El Gobierno de la India tomó el control de la investigación, que finalmente declaró inocentes tanto al Maharajá de Alwar como al de Bharatpur, y también al Diwan Narayan Bhaskar Khare de Alwar. No se presentaron cargos y todos fueron liberados.
