La Base Aérea Clark sirvió como importante centro logístico y de preparación para las operaciones militares estadounidenses en la región, y se sabe que en la base se almacenaban y manipulaban herbicidas, incluido el Agente Naranja. Estos productos químicos fueron transportados desde la Base Aérea Clark a Vietnam y otros lugares para su uso en misiones de defoliación.
El uso del Agente Naranja y otros herbicidas durante la Guerra de Vietnam se ha relacionado con efectos a largo plazo en la salud, incluidos varios cánceres, defectos de nacimiento y otras enfermedades, tanto entre los veteranos estadounidenses como entre la población local en Vietnam. El uso generalizado e indiscriminado de estos químicos ha generado preocupación sobre la contaminación ambiental y los posibles riesgos para la salud asociados con la exposición a la dioxina, un compuesto altamente tóxico que se encuentra en el Agente Naranja.