Cuando Jawaharlal Nehru prestó juramento como Primer Ministro el 15 de agosto de 1947, Sardar Patel fue nombrado Viceprimer Ministro y se le asignó el cargo del Ministerio del Interior. El Ministerio de Asuntos Exteriores permaneció en Jawaharlal. Así, tan pronto como el país se independizó, Sardar Patel tuvo tres grandes problemas como Ministro del Interior:persuadir y extinguir a los 562 estados principescos de la India, controlar los disturbios comunales, detener la estampida en el país y Pakistán. Hacer arreglos para el reasentamiento de los refugiados entrantes. Estas no fueron tareas fáciles, pero Dios hizo a Sardar Patel para tareas difíciles.
Por eso Sadar se dedicó a estas tres obras simultáneamente. Los refugiados procedentes de Pakistán traían noticias de hindúes asesinados y saqueados en grandes cantidades, por lo que la violencia comunitaria alcanzó su punto máximo desde Amritsar hasta Delhi. Para controlar esta situación se requirió una gran sensibilidad humana y una gran fuerza de voluntad.
Sardar Patel visitó Punjab y organizó una gran reunión pública en Amritsar y explicó a los sijs que si no se detiene la violencia, el período de violencia en Pakistán durará mucho tiempo. Por eso será más difícil que tus hermanos salgan de allí. Los incidentes de violencia en Punjab disminuyeron significativamente después de la visita de Sardar Patel a Punjab.
Además de esto, Sardar Patel reprimió estrictamente los disturbios en Delhi. Sardar Patel había criticado duramente la actitud dogmática de Jinnah y sus asociados antes de la creación de Pakistán, por lo que muchos líderes del Congreso acusaron a Sardar Patel de ser antimusulmán. Sobre esto, Gandhiji dijo en una entrevista a un periodista que es un error entender a Sardar Patel porque su método para resolver el problema hindú-musulmán es diferente al mío y a Sardar, pero llamarlo antimusulmán sería rechazar la verdad. P>
Pyarelal, un gran ayudante de Gandhiji, ha escrito:'A veces se ve a Sardar Patel como un enemigo de los musulmanes y de Pakistán, pero no puede haber un crimen mayor que éste. Fueron los Sardar quienes decidieron que los musulmanes que decidieron quedarse aquí considerando a la India como su hogar, deberían ser tratados bien y deberían obtener justicia.
Morarji Desai, quien más tarde se convirtió en Primer Ministro de la India, escribió:"Tuve la oportunidad de trabajar bajo el liderazgo de Sardar durante unos 20 años; basándose en mi experiencia personal, puedo afirmar que Sardar era la única persona que era comunal". , casta o religión. Estaba libre de prejuicios religiosos y tenía buena voluntad hacia todas las religiones y comunidades.'
