El Proyecto Manhattan fue un proyecto de investigación y desarrollo ultrasecreto que produjo las primeras bombas atómicas durante la Segunda Guerra Mundial. Fue liderado por Estados Unidos, con el apoyo del Reino Unido y Canadá. El proyecto recibió su nombre de la ubicación de su sede en la ciudad de Nueva York.
La investigación sobre accidentes ovni no está relacionada con el Proyecto Manhattan. No se sabe que el Proyecto Manhattan haya investigado ovnis u objetos voladores no identificados.