Después de la captura de la ciudad por los occidentales, en 1204, y el establecimiento del estado de Nicea, el ejército bizantino cambió en gran medida. Al reconocer la incapacidad de la caballería bizantina para oponerse a los caballeros latinos, los líderes del Imperio de Nicea formaron unidades de caballeros mercenarios, la llamada alegia "latina". Y el organismo que formaron se llamó "Latinicon". Los cominenos también habían utilizado mercenarios latinos anteriormente, pero no en la medida y la importancia que lo hicieron sus sucesores. Al mismo tiempo, sin embargo, también se produjeron cambios en los "soldados" nativos.
Durante este período el ejército bizantino cambió su organización. Así las antiguas órdenes fueron abolidas y reemplazadas por allaya , unidades que se cree que tenían una fuerza de unos 500 hombres. Los altares se mencionan, por primera vez, en las "Tácticas" de León VI el Sabio, junto a los batallones, denotando exclusivamente unidades de caballería, quizás mercenarios.
El término cambio probablemente proviene del latín ala, que a su vez probablemente proviene del griego ilis. Según otra versión, el término proviene de la palabra cambio, ya que estos departamentos se alternaban en el servicio. Los alae romanos tenían una fuerza de mando de 480 a 720 jinetes. En la época de Augusto también se formaron alas de infantería auxiliar. En el ejército bizantino tardío no se conoce con precisión la composición de los cambios.
La mayoría de las fuentes, sin embargo, nos permiten suponer que tenían una fuerza teórica de 200 a 500 hombres. En la Crónica de Moreos, sin embargo, el general Constantinos Paleólogo parece tener, en 1260, 18 batallones, con una fuerza total de 6.000 hombres , en fuerza, cada uno de unos 330 hombres. Cada cambio estaba comandado por el cambiador, un oficial equivalente a un conde o mayor. Los alae romanos estaban formados por 16 ulama de 30 hombres.
Sin embargo, en el ejército bizantino la turma era una unidad a nivel de grupo. Los altares estaban compuestos por pronoirianos. Otras unidades, los llamados "kastrini", se encargaban de la vigilancia de ciudades y fortalezas, contra ciertos beneficios del estado, en tierras, dinero o exenciones de impuestos. Las fuentes bizantinas mencionan los altares con varias designaciones individuales, como "altares reales", "grandes altares", "altares auténticos", pero también órdenes. Georgios Pachymeris menciona historias de varias regiones del Imperio, pero también historias de mercenarios latinos y cumanos.
Él, sin embargo, identifica los alters con los batallones . Evidentemente los grandes batallones eran formaciones a nivel de regimiento o formaciones a nivel de brigada, en términos actuales, a las que se incorporaron los batallones o batallones originales. El término alegía real obviamente denota unidades de la guardia imperial.
El término Soldado, en el ejército bizantino, significaba exclusivamente un guerrero a caballo. Los soldados de infantería fueron nombrados según las armas que portaban. Los mejores Soldados de la época portaban peto de cadena o de cuero o franela, casco, escudo, espadas y lanza larga. Los menos armados no llevaban corazas. También fueron llamados "pronoiarianos" porque como recompensa por sus servicios recibían tierras, o remuneración monetaria o exención de impuestos, las llamadas provisiones o economías.
Desde el momento en que Miguel ascendió al trono de Constantinopla, hizo todos los esfuerzos posibles para reconstruir el ejército bizantino. Así, el "Latinicon" fue abolido gradualmente. Muchos de sus hombres ya habían sido helenizados y permanecían en el ejército reorganizado como los "Cavaliers" , pero que fueron entrenados para luchar, como los caballeros occidentales, es decir, para realizar rápidas estocadas con la lanza.
La Caballería, el cuerpo más elitista de la caballería, estaba superada en número. Constituían sólo 1/5 de la fuerza total de caballería y probablemente formaban parte de los cambiantes reales . El resto de la caballería pesada estaba formado por batallones de soldados de avanzada. Los Soldados portaban, al igual que la Caballería, lanzas, espadas, escudos y alabardas. Pero mientras que los Cavaliers generalmente usaban petos de cadena, los soldados usualmente usaban armaduras inferiores:una cadena corta o un peto de cuero.
Además, los soldados estaban atrasados en el entrenamiento, ya que no estaban permanentemente en armas, sino que eran llamados a servir cuando surgía la necesidad. Los soldados propietarios también eran los Akrites de la época de Miguel VIII, que custodiaban las fronteras orientales del estado, hasta el momento en que Miguel les impuso fuertes impuestos, en lugar de la inmunidad de la que disfrutaban hasta entonces. Este movimiento suyo tuvo consecuencias fatales, ya que la vigilancia de las fronteras fue descuidada, si no completamente abandonada, y muchos se pusieron al servicio de los turcos, especialmente a partir de principios del siglo XIV.
Un gran problema para el ejército bizantino de la época era la falta de caballería ligera en sus filas. Este problema se vio agravado por el hecho de que el principal oponente, los turcos, tenía un gran número de arqueros a caballo ligeros akinzitas. La situación se solucionó, en la época del Imperio de Nicea, mediante la contratación de un gran número de húngaros y cumanos, así como de arqueros a caballo turcos, que formaban el cuerpo llamado "escita", que había sido el primero en formado durante el período Komnenian, por mercenarios pechenegos.
Los húngaros y los cumanos fueron colonizados por el emperador Juan III Vatzis en el alto valle de Axios (Vardaris) y por ello fueron llamados Vardariotes. Los vardariotas, aunque extranjeros, fueron progresivamente helenizados y fueron considerados, a partir de cierto momento, súbditos del Imperio y no mercenarios, llegando incluso a constituir una unidad de la guardia imperial. Además, estaba el cuerpo del "Turkopoulos" , que eran selyúcidas cristianizados, principalmente turcos y turcomanos que luchaban a su manera tradicional, como arqueros a caballo ligero. Sin embargo, estos cuerpos fueron disueltos por Andrónico II.
La infantería se dividió en pesada y ligera. La infantería pesada eran unidades "Kontarata", mientras que los arqueros y psiloi se caracterizaban como infantería ligera. La infantería fue el talón de Aquiles de los últimos ejércitos bizantinos. Se utilizó principalmente para proteger ciudades y castillos y se descuidó su entrenamiento. Los Kontarats eran descendientes de los antiguos "Scutas", es decir, los satélites. Llevaban una lanza larga, una espada y un escudo largo, de estilo occidental y con forma de almendra. Los primeros yugos llevaban también una cadena o peto de cuero. Por lo general, se alineaban con cuatro yugos de profundidad. No contaban con divisiones orgánicas de arqueros, como antaño, para su apoyo directo.
Los arqueros se dividieron en dos subcategorías. El primero involucraba cuerpos de arqueros bien equipados y organizados que luchaban en formación lanzando "ráfagas" de flechas, alineadas en densa formación. Estos arqueros también llevaban armadura ligera, casco, escudo y espada y podían luchar en manada. Pero fueron pocos. Por el contrario, el grueso de los arqueros estaba formado por hombres desarmados, que además del arco también llevaban una espada o un manual.
Desde finales del siglo XIII, estos arqueros ligeros ni siquiera eran soldados, sino ciudadanos:campesinos que, basándose en obligaciones feudales o de otro tipo con el Estado, se alistaban cuando era necesario, por un período de unos pocos meses, como máximo. . Estos hombres básicamente lucharon en orden informal, como pequeños escaramuzadores y, naturalmente, no pudieron resistir una incursión de unidades más pesadas, y mucho menos una carga de caballería. En algunos casos, también se reclutó a agricultores armados únicamente con herramientas agrícolas. Como regla general, estas divisiones huyeron ante la aparición del enemigo.
En el siglo XIV, varios arqueros estaban equipados con ballestas en lugar del tradicional arco compuesto. Sin embargo, el uso de la ballesta requería un buen entrenamiento y su uso, en consecuencia, por parte de los arqueros de la milicia parroquial era limitado. La mayoría de los soldados cretenses que servían en el ejército imperial en esa época también eran arqueros. Los ballesteros eran un cuerpo separado y estaban comandados por el mariscal de campo de los Jagradors (los bizantinos llamaban a la ballesta jagra).
También había unidades de infantería ligera, que eran capaces de luchar desde el grupo, muy similar a los antiguos peltastas. Las secciones procedían principalmente del Peloponeso y concretamente de Laconian Mani. Eran los Tsakones, que también sirvieron como marines en la flota imperial. Posteriormente se formó una unidad de la guardia imperial a partir de Tsakones y otra de "Jenízaros", se desconoce la composición, organización y armamento que llevaban los hombres. Probablemente deberían identificarse con los Murtates. Los Tsakones y los llamados "Gazmouli" (descendientes de griegos y latinos) portaban escudos, jabalinas y lanzas. Los mejor armados también tenían corazas. Y las unidades de los Chacones y los Gazmouli fueron disueltas por Andrónico II, a excepción de las unidades de guardia.
La guardia imperial estaba formada por los dos batallones de los Paramones, uno de caballería y otro de caballería, de una división de Tsakonas, comandados por un Stratopedarchi, un batallón de caballería de Vardariotes, los catalanes, es decir, catalanes, que permaneció leal al Imperio y a la guarnición varega, que, sin embargo, hasta mediados del siglo XIV protegió al respectivo emperador, pero no hizo campaña fuera de Constantinopla, posiblemente debido al pequeño número de hombres que ahora poseía.>
Posteriormente, se formó una unidad de arqueros Murta, quizás turcos cristianizados u otros arqueros de élite, que estaban comandados por el Mariscal de los Murta. Algunos historiadores identifican a los Murtatri con los vardariotas o los jenízaros. Nikiphoros Grigoras menciona que el emperador Juan V Cantacuzinos tenía como guardia personal un destacamento de 500 soldados catalanes, liderados por Juan Pelatra. Además de los Paramons, los guardias formaban las llamadas Compañías. El término era antiguo y denotaba las divisiones mercenarias de la guardia imperial. Su comandante era el mega etariarco, o corporator, y el corporator era el segundo al mando. El comandante de la guardia de los Paramons llevaba el título de protalagador.
Las diversas divisiones mercenarias, catalanas, turcas, serbias, búlgaras, valacas, latinas o alanas, constituían, en la mayoría de los casos, el grueso de las tropas imperiales. Otros dignatarios de la época, con roles poco claros, fueron el Gran Arconte, el Arconte de Allagio, el Gran Chaoussios y el Acolothus. El primero parece no haber tenido ningún papel militar, a diferencia del segundo que, más bien, comandaba a los hombres de la guardia real. El Gran Chausius probablemente también tenía un papel ceremonial, mientras que el Seguidor era el jefe de la guardia varega.
Cuando estalló la guerra civil entre Juan Cantacuzeno y Juan V Paleólogo, en 1341, las fuentes afirman que Cantacuzeno, como gran doméstico (comandante en jefe), tenía 16 alters. Si estos cambios estuvieran en plena vigencia, podemos suponer que contaba con un total de unos 8.000 hombres. Un año después, sin embargo, Cantacuzeno parece tener sólo 2.000 hombres, mientras que al final de la guerra civil, cuando entró en Constantinopla, parece tener sólo 1.000 hombres.
Incluso si la mayor parte de su ejército, al comienzo de la guerra civil, estaba formado por unidades mercenarias, el progreso de esa guerra destructiva muestra el colapso total de cualquier poder militar que quedara en el Imperio. Bajo Miguel VIII, el ejército bizantino podía reunir 20.000 hombres. El declive, en pocos años, fue evidente y después de la Guerra Civil Cantacuzeno-Paleólogo, el ejército regular alcanzó unos pocos cientos de hombres...