El destino de Simoun :Se revela que Simoun, el rico joyero y cerebro del complot revolucionario, es el ex alumno y amigo de Ibarra, el protagonista de la novela anterior de Rizal, "Noli Me Tangere". La verdadera identidad de Simoun queda expuesta y finalmente se quita la vida para evitar ser capturado por las autoridades.
El levantamiento :Después de la muerte de Simoun, los diversos grupos revolucionarios que ha organizado se rebelan contra el gobierno colonial español. Sin embargo, el levantamiento fracasa por falta de coordinación y traición desde dentro.
El destino de Basilio y Juli :Basilio, el hijo de Sisa, y Juli, la joven a la que ama, se encuentran entre los implicados en el levantamiento. Basilio sobrevive pero está profundamente desilusionado por el fracaso de la revolución y la pérdida de sus ideales. Juli, en cambio, muere en el caos, trágica víctima de los hechos.
La ejecución de los cuentos de Kabesang :Kabesang Tales, ex jefe de barangay (jefe de la aldea), es ejecutado por las autoridades españolas por liderar un levantamiento campesino contra los abusos de los frailes. Su muerte pone de relieve las duras realidades de la opresión colonial y los sacrificios realizados por quienes luchan por la justicia.
La decisión de Isagani :Isagani, un joven estudiante y amigo de Basilio, está en conflicto sobre el resultado de la revolución. Elige continuar sus estudios en Europa en lugar de unirse a la lucha, creyendo que la educación y la ilustración son herramientas de cambio más efectivas que la rebelión armada.
Reflexión del Padre Florentino :El padre Florentino, un sacerdote compasivo y patriótico, reflexiona sobre la tragedia que ha azotado a su país. Entierra el tesoro dejado por Simoun y reza por el futuro de Filipinas, expresando la esperanza de que llegue el día en que la nación alcance la libertad y la independencia.
La novela termina con una nota incierta y sombría, dejando a los lectores contemplar la complejidad de la lucha filipina por la independencia y los sacrificios hechos por su pueblo en la búsqueda de la justicia y la liberación.