Encarcelamiento: Las personas que persistieran en negar las acusaciones de brujería podrían ser encarceladas por un período indefinido. Es posible que permanezcan en prisión hasta que confesen o hasta que finalmente sean liberados por falta de pruebas o cambios en la opinión pública. Las condiciones en las cárceles modernas tempranas eran a menudo duras, con condiciones sanitarias deficientes y alimentación inadecuada, lo que hacía que el encarcelamiento en sí fuera un castigo importante.
Tortura: Para obtener confesiones, en ocasiones los acusados eran sometidos a diversas formas de tortura o coerción. El método más notorio empleado en Salem era el "presionar", mediante el cual se colocaban pesos pesados sobre el pecho del acusado para obligarlo a admitir su culpabilidad. Otras formas de tortura implicaban privación del sueño, palizas o el uso de "pinchazos de bruja", en los que se insertaban agujas en la piel para encontrar supuestas "marcas de bruja".
Destierro: En algunos casos, quienes mantuvieron su inocencia podrían haber sido desterrados de la comunidad o de la colonia de la Bahía de Massachusetts. El destierro sirvió como castigo y al mismo tiempo eliminó las amenazas percibidas de la sociedad. Los individuos desterrados tenían que abandonar la zona y se les prohibía regresar, a menudo bajo amenaza de muerte si desobedecían.
Ejecución: Si un acusado se negaba a confesar y era declarado culpable a través de testimonios de otros o pruebas espectrales, se enfrentaba a la posibilidad de ser ejecutado. Durante los juicios por brujería de Salem, el método principal de ejecución fue la horca. Las personas condenadas por brujería serían ahorcadas públicamente como acto simbólico de purificación y como elemento disuasivo para los demás.
Es esencial señalar que no todos los acusados fueron sometidos a consecuencias graves. Algunos fueron puestos en libertad por falta de pruebas o sus casos fueron desestimados. Sin embargo, quienes negaron firmemente las acusaciones a menudo sufrieron encarcelamiento prolongado, tortura o la pena máxima de ejecución.