Napoleón fue encarcelado y deportado por los británicos a la Île Sainte-Hélène, comandado primero por el almirante Cockburn y luego por Sir Hudson Lowe, con una pequeña tropa de seguidores, entre ellos el conde de Las Cases, el general Montholon y el general Gourgaud, a los que dedicó. se dedicó a escribir para la posteridad sus memorias que dictó a Las Cases.
También intentó aprender inglés; recibió varios visitantes que pasaban por Santa Elena, que en aquella época era una escala importante para cualquier barco que circunnavegara África. Una vez instalado en Longwood, evitó salir porque Lowe había dado órdenes de que el Emperador estuviera vigilado en todas partes.
Poco a poco, Napoleón enfermó y se debilitó. Pidió en su testamento al general barón de Marbot que siguiera trabajando en sus escritos "por la grandeza de Francia". En la segunda quincena de abril de 1821, escribió su último testamento y él mismo varios codicilos, unas cuarenta páginas en total. Sus últimas palabras fueron:“Francia, ejército, Josefina”, o, según las memorias de Santa Elena:“cabeza... ejército... ¡Dios mío! ". Nerval, en su poema À la mort de l'Exilé, señala:"Las últimas palabras del moribundo Napoleón fueron:'Dios mío y la nación francesa... francesa... mi hijo... cabeza armada'. No sabemos qué significaban esas palabras. y una versión común afirma que en realidad dijo "jefe del ejército", lo cual es mucho menos enigmático.
Napoleón murió un sábado 5 de mayo de 1821, "a las 17:49". Las causas de su muerte han sido objeto de controversia, oficialmente los médicos concluyeron que murió de cáncer de estómago, pero se planteó la hipótesis de envenenamiento por arsénico.