Contexto político
Tras los acontecimientos, mantener el vínculo entre la región oriental y el resto de Nigeria se vuelve cada vez más difícil. En el gobierno central, Gowon, a diferencia de Ironsi, se rodea de políticos derrocados del anterior gobierno, mayormente provenientes de los territorios occidentales o de áreas habitadas por minorías. Todos ellos, convertidos en fervientes federalistas, instan a Gowon a adoptar medidas enérgicas para impedir la secesión y preservar el poder central.
Esta postura cuenta con el respaldo de los representantes británicos, que desean mantener la unidad de Nigeria no solo por razones sentimentales e históricas, sino principalmente para conservar el control de los campos petroleros bajo el gobierno central, ya que el país suministra a Gran Bretaña una cuarta parte del petróleo que necesita.
Estrategias y negociaciones
Disuadir a los líderes musulmanes del norte de la secesión resulta relativamente sencillo. Sin embargo, recuperar la confianza de los ibos, retraídos y traumatizados por las masacres, requiere más que palabras. A pesar de las dificultades, se alcanzaron acuerdos en una reunión de líderes militares en Ahuri, Ghana, en enero de 1967. Pero, al regresar a Lagos, los asesores de Gowon lo convencieron de revocar los pactos firmados en Ahuri.
Reorganización del país
Al finalizar mayo, con la tensión en aumento, Gowon declara que Nigeria se dividirá en doce estados bajo un fuerte gobierno central. Con ello se pone fin al dominio del Norte y se busca satisfacer a las minorías. Resulta significativo que los nuevos estados propuestos para la región oriental priven a los ibos de cualquier control sobre los campos petroleros.
Secesión de Biafra
Como era de esperar, Ojukwu anuncia pocos días después que todos los territorios orientales se separan y forman un estado independiente llamado Biafra.
La “pequeña acción policial”
Desde Lagos se cree que será fácil reincorporar a los ibos a la federación. El 7 de julio, Gowon anuncia que se llevará a cabo una "pequeña acción policial" contra Biafra.