En 1890 Melville Macnaghten, quien había participado en la investigación, asumió la dirección del Departamento de Investigación Criminal (CID) de Scotland Yard. Según su informe, el asesino cometió únicamente cinco homicidios —las víctimas "canónicas" de Mary Ann Nichols, Annie Chapman, Elizabeth Stride, Catherine Eddowes y Mary Jane Kelly— y señaló a tres sospechosos principales: Montague J. Druitt, Aaron Kosminski y Michael Ostrog. Desde 1888, sin embargo, se han propuesto numerosos culpables, muchos de ellos basados en pruebas poco sólidas.
Aaron Kosminski
El inspector Robert Anderson, jefe del CID durante los crímenes, describió al autor como un judío polaco, enfermo mental y de origen humilde, identificándolo con el barbero A. Kosminski mencionado por Macnaghten. En 2014 se anunció que el ADN mitocondrial de descendientes vivos de Kosminski coincidía con el de una chalina hallada en la escena del asesinato de Eddowes. Sin embargo, esos hallazgos son controvertidos: la chalina no está confirmada como perteneciente a la víctima y la coincidencia de ADN mitocondrial es demasiado común para ser concluyente.
Montague J. Druitt
Macnaghten describió a este abogado de familia acomodada como "sexualmente enfermo", término que en la época aludía a la homosexualidad; se dice que fue expulsado en 1888 de la escuela donde enseñaba. Tres semanas después del asesinato de Kelly, Druitt se suicidó lanzándose al Támesis. El inspector Frederick Abberline, responsable de la investigación, no encontró pruebas que lo implicaran directamente.
Walter Sicklert
El pintor, autor de la obra The Bedroom of Jack the Ripper, mostró un notable interés por el caso. La escritora Patricia Cornwell lo acusó de los asesinatos, argumentando que presentaba rasgos psicopáticos. Se halló una coincidencia de ADN mitocondrial entre una carta escrita por la madre de Sickert y una supuesta carta del Ripper, pero dicho tipo de ADN es compartido por alrededor del 10 % de la población, lo que invalida la evidencia.
John Pizer
Zapatero judío apodado "Leather Apron" (delantal de cuero) porque nunca se lo quitaba, incluso al salir a la calle. Fue detenido dos días después del asesinato de Annie Chapman, la segunda víctima, tras ser acusado por una esposa de haberla amenazado con un cuchillo. Aunque había agredido a prostitutas en el pasado, disponía de sólidas coartadas para las noches de los dos homicidios atribuidos al Ripper.
La conspiración real
En 1976 el escritor británico Stephen Knight publicó Jack the Ripper: The Final Solution, una obra que sostiene que los asesinatos de Whitechapel fueron parte de un complot de la familia real. Según esta teoría, el príncipe Alberto, nieto de la reina Victoria, era víctima de chantaje porque había tenido una hija con una prostituta; sus allegados amenazaban con revelar el escándalo a menos que se les pagara. La supuesta solución consistiría en atribuir los crímenes a un personaje ficticio, Jack el Destripador, para desviar la atención. Knight también implicó al doctor William Gull, médico personal de la reina, como coautor de los asesinatos. La hipótesis ha sido desacreditada por los expertos, aunque sigue circulando en la cultura popular.