Balboa nació en Jerez de los Caballeros, España, en 1475. Provenía de una familia noble y recibió una buena educación. En 1500 se unió a una expedición al Nuevo Mundo dirigida por Alonso de Ojeda. La expedición exploró la costa de América del Sur y fundó la colonia de Santa María la Antigua del Darién.
En 1513, Balboa dirigió una expedición a través del istmo de Panamá. Él y sus hombres caminaron a través de la densa jungla y las montañas. Fueron los primeros europeos en ver el Océano Pacífico desde el Nuevo Mundo. Balboa reclamó para España el Océano Pacífico y todas las tierras que tocaba. Llamó al océano "Mar del Sur".
El descubrimiento del Océano Pacífico por parte de Balboa fue un acontecimiento importante en la historia de la exploración. Abrió una nueva ruta hacia Asia y las Islas de las Especias. También condujo a la conquista española del Imperio Inca.
Balboa fue nombrado gobernador de Panamá en 1514. Fue un gobernador duro e impopular. Fue ejecutado en 1519 por orden del gobernador español de La Española, Pedro Arias Dávila.
Balboa es recordado como uno de los exploradores más importantes del Nuevo Mundo. Su descubrimiento del Océano Pacífico fue un importante punto de inflexión en la historia.