Además de sus esfuerzos científicos y comerciales, Thomas también fue un filántropo activo y partidario de varias instituciones educativas y organizaciones benéficas. Fue miembro fundador de la Asociación Estadounidense para el Avance de la Ciencia y fue su presidente de 1872 a 1874. También fue miembro de la Academia Nacional de Ciencias y de la Sociedad Filosófica Estadounidense.
A lo largo de su vida, Thomas recibió numerosos honores y premios por sus contribuciones a la ciencia y la tecnología. Recibió la Medalla de Oro del Congreso en 1928 y fue incluido en el Salón de la Fama de los Inventores Nacionales en 1973. También fue reconocido internacionalmente y recibió premios y honores de países como Francia, Alemania e Italia.
Thomas murió el 18 de octubre de 1931, a la edad de 84 años. Dejó un legado de innovación y logros científicos que continúa influyendo e inspirando a personas de todo el mundo.
