Con la llegada de Hamás al poder en 2006 y el nombramiento de un primer ministro del partido, la Autoridad Nacional Palestina (ANP) quedó aislada internacionalmente. La Unión Europea y Estados Unidos han suspendido una ayuda financiera de mil millones de dólares anuales, lo que representa casi la mitad del presupuesto de la ANP. Así, el gobierno palestino se quedó sin recursos ni siquiera para pagar los salarios de sus empleados.
Para convencer a la Unión Europea y a Estados Unidos de suspender el boicot, el presidente de la ANP y miembro de Fatah, Mahamoud Abbas, propuso la formación de un gobierno de colisión, obligando a Hamás a aceptar las condiciones impuestas por Israel para volver a las negociaciones.
A finales de 2006, el presidente amenazó con disolver el Parlamento y adelantar las elecciones, la gota que colmó el vaso. Comenzaron sangrientos conflictos entre quienes apoyaban a Fatah y Hamás. Enfrentamientos que dejaron 75 muertos sólo en los dos primeros meses.
Abbas y el Primer Ministro Hanyieh firmaron el Acuerdo de La Meca en febrero de 2007, que, al menos temporalmente, puso fin al conflicto. Sin embargo, en julio del mismo año, Abbas puso fin al gobierno de unidad nacional, liderado por Hamás, después de que los radicales tomaran el control de la región.
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