Después de la creación de Pakistán, Jinnah se volvió solitaria e irritable. Había tenido en sus manos la mayor y la menor autoridad de la nación. Su secretario militar, el coronel Burney, escribió en su diario:'La condición de Jinnah se había vuelto como la de un niño que había encontrado la luna por algún milagro y ahora no estaba listo para abandonarla ni por un momento. .
…… Por lo tanto, se recortó el salario de los empleados que llegaron a Pakistán después de huir de la India. Jinnah tuvo que soportar la humillación que era motivo de vergüenza para un hombre tan orgulloso.
…… Después de la creación de Pakistán, el gobierno de Jinnah fletó un avión de la British Overseas Air Corporation, que se utilizó para transportar refugiados. El gobierno emitió un cheque para el pago de la corporación que fue rebotada. Porque no había tanta cantidad en la cuenta.'
En 1947, una semana después de la toma de posesión del nuevo primer ministro y del gabinete, cuando la gente en Pakistán celebraba la primera festividad de Eid-ul-Fitr después del Ramadán, Jinnah derrocó mediante referéndum al gobierno electo de la Provincia de la Frontera Noroeste. El Ministro Principal de la provincia, Dr. Khan, tenía una mayoría sustancial, pero Jinnah consiguió que se formara allí el gobierno de su partido.
Cuando el gobierno formado por Jinnah no logró obtener un voto de confianza en la asamblea legislativa provincial, Jinnah hizo arrestar a todos los miembros despedidos y así se creó una mayoría artificial. Nueve meses después, Jinnah derrocó al gobierno de la provincia de Sindh, que era su propio partido. Después de esto, Jinnah intentó derrocar al gobierno de la provincia de Punjab en el palacio.
Intentos de Jinnah de difamar a la India Muhammad Ali Jinnah, alguna vez considerado un mensajero de la unidad hindú-musulmana, dedicó la máxima energía de su vida a conquistar Pakistán. Fue el único gracias al cual se formó Pakistán, pero cuando se creó Pakistán, Jinnah acusó a India de no tener relaciones amistosas con Pakistán. Siete meses después de la creación de Pakistán, le dijo al embajador de Estados Unidos en Pakistán, Paul Elling, que él (el deseo de Jinnah) era tener la misma cooperación entre India y Pakistán que entre Estados Unidos y Canadá.
Paul Elling, en su telegrama diplomático enviado a Washington, escribió que Jinnah discutió la asociación defensiva a nivel militar de Pakistán con la India que no tenía fronteras fijas. Habría sido una asociación similar a la entre Estados Unidos y Canadá, con una frontera en gran medida sin vigilancia entre los dos vecinos, fuerzas militares compartidas, libre comercio y libertad para ingresar al territorio del otro a través de múltiples rutas. Lo habría hecho.
